员工持股从根本上改变了企业的股权结构和公司治理结构。现代企业理论和实践都证明，优化的产权结构是现代公司快速地发展、科学地决策和有效地控制风险的根本保证。从公司治理的角度来看，只有适当的产权分散，才能建立起合理的治理结构,而有了合理的治理结构，公司的股东大会、董事会、管理团队才能各司其职，避免现代企业的代理问题、机会主义、寻租行为等弊端，有助于建立科学的管理体系和人力资源体系。只有在优化的公司产权结构上，才能建立优化的公司资本结构，才能有效地利用和组织各种资源，保证公司的利润追求和资产扩张。
实行员工持股制度能有效地协调企业的利益矛盾，能给法人治理结构注人活力，特别是员工持股比例占优势的企业更为明显。比如德国西门子公司、美国联合航空公司，员工股权均达到50%以上。实践证明，由于员工成为产权主体，公司在民主科学管理方面产生了一系列重要变化，员工不仅在理论上可以参与决策，参与监督，而且实际进人决策中心，进人管理部门。
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